根据《中共中央 国务院关于辽宁省人民政府机构改革方案的通知》(中委〔2000〕35号)和省委、省政府决定，组建辽宁省国土资源厅，正厅级建制。辽宁省国土资源厅是主管土地资源、矿产资源(含海洋矿产资源)等自然资源的规划、管理、保护与合理利用的省政府组成部门。
一、职能调整
(一)划入的职能
1、原省土地局承担的行政管理职能。
2、原省地矿厅承担的行政管理职能。
3、原省计委制定国土规划和与土地利用总体规划有关的职能。
4、原省冶金厅、煤炭局、石化厅等部门行使的矿产资源行政管理职能。
5、原省国有资产管理局承担的国有资源实行资产化管理的有关职能。
6、海洋矿产资源的行政管理职能。
(二)转变的职能
1、不再承担地热、矿泉水勘查报告的审批职能。
2、不再承担经销矿产品许可证的审批职能。
3、不再承担矿产资源补偿费纳费登记的审批职能。
4、将临时用地的审批职能交给市级人民政府。
5、全省基础性、公益性、战略性地质和矿产勘查任务，交给直属地质勘查事业单位承担。
6、土地资源、矿产资源、海洋矿产资源基础信息和资源利用情况、变化趋势的动态数据收集、技术处理及预测分析等职能，交给事业单位承担。
7、实行政企分开，国土资源厅不从事土地、矿产资源的经营活动，不再管理企业及企业生产经营开发活动。
(三)强化的职能
省国土资源厅要在保护生态环境的前提下，加强自然资源的保护与管理，尤其要加强耕地保护和土地管理，保障全省人民生活和现代化建设当前和长远发展的需要。
二、主要职责
(一)贯彻实施有关法律、法规，研究拟定并贯彻实施管理、保护与合理利用土地资源、矿产资源、海洋矿产资源政策；依照规定负责有关行政复议；制定全省土地资源、矿产资源、海洋矿产资源管理的技术标准、规程、规范和办法。
(二)组织编制和实施全省国土规划、土地利用总体规划、地质调查规划和其他专项规划；参与报省政府审批的城市总体规划的审核；指导审核各市土地利用总体规划；组织矿产资源、海洋矿产资源的调查评价，编制矿产资源、海洋矿产资源保护与合理利用规划、地质勘查规划、地质灾害防治和地质遗迹保护规划。
(三)监督检查全省各级国土资源主管部门行政执法和土地资源、矿产资源、海洋矿产资源规划执行情况；依法保护土地资源、矿产资源、海洋矿产资源所有者和使用者的合法权益，调处重大权属纠纷，查处重大违法案件。
(四)拟定并实施全省耕地特殊保护和鼓励耕地开发政策，实施农地用途管制，组织基本农田保护，指导未利用土地开发、土地整理、土地复垦和开发耕地的监督工作，确保耕地面积只能增加，不能减少。
(五)管理全省城乡地籍地政工作，贯彻地籍管理办法，组织土地资源调查、地籍调查、土地统计和动态监测；负责土地确权、城乡地籍、土地定级和登记等工作。
(六)按规定组织实施土地使用权出让、租赁、作价出资、转让、交易和政府收购管理办法；实施乡(镇)村用地管理办法；指导对农村集体非农土地使用权的流转管理。
(七)实施基准地价、标定地价测评；审定评估机构从事土地评估的资格；确认土地使用权价格；承担报省政府审批的各类用地的审查、报批工作。
(八)依法管理全省矿产资源探矿权、采矿权的审批登记发证和转让审批登记；在授权范围内，依法审批对外合作勘查、开采区块；承担矿产资源储量管理工作，管理地质资料汇交；依法实施全省地质勘查行业管理，审查确定地质勘查单位的资格，管理地勘成果；按规定管理矿产资源补偿费的征收和使用；审定评估机构从事探矿权、采矿权评估的资格，确认探矿权、采矿权评估结果；负责全省地质调查综合统一管理工作。
(九)组织监测、防治地质灾害和保护地质遗迹；依法管理水文地质、工程地质、环境地质勘查和评价工作，监测、监督防止地下水的过量开采与污染，保护地质环境；认定具有重要价值的古生物化石产地、标准地质剖面等地质遗迹保护区。
(十)安排并监督检查省财政拨给的地勘费和其他资金。
(十一)组织开展土地资源、矿产资源、海洋矿产资源的对外合作与交流。
(十二)承办省政府交办的其他事项。
根据规定，管理辽宁省测绘局。
三、内设机构
根据上述职责，省国土资源厅设13个职能处室。
(一)办公室
组织协调机关日常工作，负责有关文件的起草、重要会议的组织、文秘、综合、档案、信访、保密、保卫、财务及资产管理等工作。
(二)政策法规处
研究起草全省有关土地资源、矿产资源、海洋矿产资源政策法规草案；组织有关法律法规的宣传教育；组织协调厅内有关立法工作；办理有关行政复议事宜；指导、检查全省土地资源、矿产资源、海洋矿产资源政策、法规的贯彻执行情况；调研和起草综合性土地资源、矿产资源、海洋矿产资源政策。
(三)规划处
组织研究全省和重点地区国土综合开发整治的政策措施；起草编制全省性及区域性的国土规划、土地利用总体规划、矿产资源和海洋矿产资源保护与合理利用规划、地质环境规划；编制全省地质调查规划；实施土地供应政策；指导和审核全省基本农田保护规划、土地复垦规划、土地整理规划、未利用土地开发规划等专项规划和土地利用总体规划；参与报省政府审批的城市总体规划的审核工作。
(四)财务处
组织拟定全省土地、矿产行业财务管理方面的规章制度，对直属单位的财务和国有资产进行监督管理；承担省财政拨给的地勘费和其他资金的财务管理工作；对本行业的各项行政事业性收费进行财务监督管理；对矿产资源补偿费征收使用进行监督管理。
(五)耕地保护处
拟定全省耕地特殊保护和鼓励耕地开发政策、农地保护和土地整治政策、农地转用管理办法；拟定全省未利用土地开发、土地整理、土地复垦和开发耕地规定；实施农地用途管制；组织基本农田保护。
(六)地籍管理处
实施地籍管理办法和有关调查、监测、统计的技术规范、标准；组织全省土地资源现状调查、动态监测、地籍权属调查、变更调查及统计；实施土地权属纠纷调处规则和管理办法；调处重大或跨市土地权属纠纷。
(七)土地利用管理处
指导实施土地使用权出让、租赁、作价出资、转让、交易和政府收购管理办法；拟定全省乡(镇)村土地使用管理办法；指导农村集体非农土地使用权的流转管理；指导基准地价、标定地价测评；指导审核评估机构从事土地评估资格、确认土地使用权价格。
(八)矿产开发管理处
依法进行采矿审批登记发证和采矿权转让审批登记；依法调处重大采矿争议、纠纷；审核评估机构从事采矿权评估的资格；审核国家出资形成的采矿权评估结果；依法进行矿产资源开发、利用与保护的监督管理；依法征收矿产资源补偿费。
(九)矿产资源储量处(省矿产储量委员会办公室)
组织实施矿产资源储量管理办法、标准、规程、规范；组织建立健全矿产资源储量评价的专家系统；承担全省矿产资源储量管理和地质资料汇交管理工作；组织矿产资源供需形势分析；贯彻实施矿产资源政策。
(十)地质环境处
组织制定地质遗迹等地质资源和地质灾害防治管理办法；编制地质灾害防治和地质遗迹保护规划并监督检查实施情况；组织协调重大地质灾害防治；指导地质灾害和地下水动态监测、调查评价，负责发布全省地质灾害预报；对地热、矿泉水勘查、鉴定、评价及开发利用实施监督管理；认定具有重要价值的古生物化石产地、标准地质剖面等地质遗迹保护区。
(十一)地质勘查处
执行地质勘查工作标准、规程、规范；组织对矿产资源、海洋矿产资源进行调查评价，监督检查地质勘查规划的执行情况；依法进行勘查审批登记发证和探矿权转让审批登记；参与中外合资、合作和外资在全省矿产资源勘查项目的审核；依法调处重大地质勘查争议、纠纷；审核评估机构从事探矿权评估资格，审核国家出资形成的探矿权评估结果；对全省地质调查工作进行统一综合管理。
(十二)执法监察处
对执行和遵守国家土地资源、矿产资源、海洋矿产资源法律法规情况进行监督检查；拟定全省土地、矿产执法监督和土地、矿产违法案件查处规定；组织开展对土地规划、农地转用、土地征用、土地资产处置、土地使用权交易；矿产资源的规划分配、地质勘查、储量审批、矿产开发、地质环境、矿业权转让、矿产资源补偿费的征收使用等行为的监督检查；依法查处重大土地、矿产、违法案件。
(十三)人事教育处(科技外事处)
负责机关及直属单位的机构编制、人事管理和教育培训工作。编制全省国土资源科技与外事工作规划，对重大科技项目和外事工作的实施情况进行监督检查；推广科技成果；承办厅机关及直属单位对外合作与交流事务。
机关党委 负责机关及直属单位的党群工作。
设置纪检组、监察处 合署办公，负责纪检和行政监察工作。
四、人员编制和领导职数（略）
五、其他事项
(一)省国土资源厅对市级人民政府国土资源主管部门实行业务领导；市级人民政府国土资源主管部门主要领导干部的任免，需征得省国土资源厅的同意。
(二)关于矿泉水、地热水的职责分工问题。开采已探明的矿泉水、地热水由水利部门办理取水许可证，确定开采限量。对其中开采矿泉水、地热水，用于商业经营的企事业单位，凭取水许可证向国土资源部门登记，办理相应的采矿许可证，并按照水行政主管部门确定的开采限量开采。